Rákóczi-féle felkelés, vagyis a kuruc-labanc háború után annyira leromlott az ősi templom állaga, hogy 1681-ben a híres Szelepcsényi György érsek újra felépíttette Illésháza templomát, mely ezúttal gótikus (csúcsíves) stílust kapott. A romossá vált templomban csodával határosan megmaradtak az oltáron Szent Péter és Pál apostolok szobrai, valamint megőrződött az 1458-ból való, fából faragott Szűz Mária-szobor is. 1780-as években Gróf Illésházy János az ismét rozzanttá vált templom helyén új, az addiginál tágasabb hajóval bíró templomot építtetett. Visszakerültek az új templom oltárára Szent Péter és Pál apostolok szobrai is. Illésházán azóta is Szent Péter és Pál apostolok temploma néven szolgál az istenháza.

1770-1987-ig 19 plébánosa volt Illésháza eklézsiájának. Hogy közben miért változtak oly sűrűn a plébánosok, nem tudni.